- 奥山雄大 2018 多様な花が生まれる瞬間 斎藤成也ら監修、シリーズ・遺伝子から探る生物進化６ 慶應義塾大学出版会 196p
- 五百川裕、奥山雄大 2017 スイカズラ科 大橋広好ら（編）、改訂新版 日本の野生植物 5 平凡社 pp. 413-428.
- 篠田謙一、奥山雄大、川田伸一郎、清拓哉、真鍋真、門馬綱一、矢部淳、米田成一（監修） 2017 大英自然史博物館の至宝250 創元社268p
- 奥山雄大 2016 ユキノシタ科 大橋広好ら（編）、改訂新版 日本の野生植物 2 平凡社 pp. 197-214.
- 奥山雄大 2015 まだ見ぬ宝を求めて＜植物学＞ 増田研、梶丸岳、椎野若菜（編）フィールドの見方 古今書院 pp14-26
- ヴォルフガング・シュトゥッピー、ロブ・ケスラー、マデリン・ハーレー(著)、奥山 雄大 (監修)、武井 摩利 (翻訳) 2014 植物の奇妙な生活: 電子顕微鏡で探る驚異の生存戦略 創元社 144p
- ヴォルフガング・シュトゥッピー、ロブ・ケスラー(著)、奥山 雄大 (監修)、武井 摩利 (翻訳) 2012 世界で一番美しい果実図鑑 創元社 264p
- ロブ・ケスラー、ヴォルフガング・シュトゥッピー(著)、奥山 雄大 (監修)、武井 摩利 (翻訳) 2012 世界で一番美しい種子図鑑 創元社 264p
- 川北篤、奥山雄大（編集） 2012 種生物学研究第35号「種間関係の生物学：共生・寄生・捕食の新しい姿」 文一総合出版 400p
- マデリン・ハーレー・ロブ・ケスラー (著)、奥山 雄大 (監修)、武井 摩利 (翻訳) 2011 世界で一番美しい花粉図鑑 創元社 264p
- 加藤雅啓・海老原淳（編集）、奥山雄大、他（分担執筆）2011 日本の固有植物 (国立科学博物館叢書) 503p
- Rakshit, S., H. Kanzaki, H. Matsumura, A. Rakshit, T. Fujibe, Y. Okuyama, K. Yoshida, M. O. Tamiru, M. Shenton, H. Utsushi, C. Mitsuoka, A. Abe, Y. Kiuchi, R. Terauchi, 2010. Use of TILLING for reverse and forward genetics of rice. In: Meksem, K. and G. Kahl, (eds.) The Handbook of Plant Mutation Screening: Mining of Natural and Induced Alleles. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim, Germany
- 奥山雄大・川北篤 2008 第11章 系統解析プロトコル：塩基配列から分子系統樹へ 種生物学研究第31号「共進化の生態学」 文一総合出版 pp.313–340
- 奥山雄大 2008 第3章 小さな花に秘められたパートナーシップ：チャルメルソウ類多様化の歴史を復元する 種生物学研究第31号「共進化の生態学」 文一総合出版 pp.83–107
奥山 雄大 Yudai Okuyama
出版物（著書・訳書）